Possui portada única, com duas janelas do coro (todas essas fenestras em arco abatido), conformando os "vãos em v" típicos das igrejas e capelas coloniais mais antigas do Brasil. Apesar das volutas do frontão e zimbório terem sido modificadas em sucessivas reformas, possui uma volumetria ainda original, contando com torre única com campanário simples na lateral esquerda e contraforte na parte direita, acrescentada no século XIX. Foi originalmente erguida em pedra e cal, no Engenho de Salvador Correia de Sá e aparece citada no auto de medição das terras da Ilha do Governador, de 30 de março de 1662. Em 1816, sofreu sua primeira reforma, que acrescentou a ala esquerda, como mostra a inscrição na fachada. Durante o século XX, ocorreram outras reformas. Entre 1999 e 2000, foi realizada uma restauração que devolveu as feições originais do retábulo mor.
